Это баг. Это можно обойти, если нажимать "сохранить" на больших зумах.
Иногда получается, что после сохранения изменяется геометрия скругленного угла на нескругленную, без изменения количества точек. Пример объекта со скринов: https://n.maps.yandex.ru/-/CGDsrIJu Первый скрин - скругленный угол до сохранения, второй скрин - выпрямленный обратно угол сразу после сохранения. Если удалить лишние точки и скруглить заново - обычно сохраняется корректно.
По факту это начальная\конечная точка контура всегда приклеивается к старым координатам, если её новые координаты (при перерисовке\смещении\скруглении) находятся в паре метров от старых.